Перед тем, как ехать в Чили, рекомендуется сделать иммунизацию против гепатита и столбняка. Иногда можно встретить эпидемические вспышки малоизвестного менингококкового менингита. Что касается сельских районов, то там встречаются случаи заражения бешенством и болезнью Чагаса.

Общее количество опасных для здоровья животных и рептилий невелико. Но в Чили обитают два вида ядовитых пауков (черная вдова и чуланный паук), укус которых опасен и даже смертелен для человека. Чуланный паук встречается сравнительно повсеместно, обитает во многих жилых домах Чили. В провинциях определенную опасность несут обычные грызуны, которые являются распространителями так называемой геморрагической лихорадки. Если вы решили разбить лагерь или остановиться на ночевку, то настоятельно советуем избегать мест расселения этих животных. В крупных городах и деревнях огромное количество бездомных собак, так что часто встречаются случаи заражения блохами.

Летом и в теплые месяцы в некоторых акваториях Чили вода как говорится «зацветает» из-за взрывного размножения некоторых видов микроскопических водорослей (это называется «эффектом красного прилива»). В районах цветения воды нельзя купаться, употреблять в пищу, пойманную здесь рыбу и морепродукты, так как некоторые виды данных микроорганизмов смертельно опасны для человека. В мясе рыб и морских животных в этот период накапливаются очень сильные яды, венерупин и сакситоксин, которые обладают нервно-паралитическим действием. Также в воде резко снижается уровень содержания кислорода, так что она часто отравлена продуктами разложения погибших моллюсков и рыбы.

Абсолютно вся вода должна расцениваться загрязненной в потенциальном смысле. Для чистки зубов, приготовления льда, а особенно для питья нужно использовать кипяченую воду. Рыба и мясо должны обязательно подвергаться термической обработке. Соусы, салат и свинина могут быть источниками высокого риска. Овощи нужно тщательно мыть, а фрукты и плоды деревьев или кустарников еще и очищать от кожуры.

В океане можно купаться лишь в строго отведенных для этого местах, например, на оборудованных пляжах. Местные спасатели и береговая полиция каждый день работает, причем на очень высоком уровне, но рисковать все же не рекомендуется.